Protein–RNA interactions for Protein: P01797

Ig heavy chain V-III region U61, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01797 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01797 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01797 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01797 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01797 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01797 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01797 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01797 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01797 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01797 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01797 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01797 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01797 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01797 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01797 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01797 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01797 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01797 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01797 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01797 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01797 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01797 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01797 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01797 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01797 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01797 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01797 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01797 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01797 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01797 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01797 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01797 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01797 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01797 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01797 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01797 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01797 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01797 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01797 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01797 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01797 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01797 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01797 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01797 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01797 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01797 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01797 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01797 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01797 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01797 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01797 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01797 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01797 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01797 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01797 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01797 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01797 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01797 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01797 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01797 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01797 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01797 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01797 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01797 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01797 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01797 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01797 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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P01797 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01797 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01797 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01797 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01797 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01797 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01797 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01797 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01797 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01797 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01797 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01797 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01797 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01797 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01797 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01797 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01797 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01797 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01797 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01797 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01797 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01797 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01797 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01797 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01797 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01797 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01797 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P01797 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01797 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01797 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms