Protein–RNA interactions for Protein: P01663

Ig kappa chain V-III region PC 4050, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01663 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01663 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01663 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01663 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01663 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01663 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01663 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01663 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01663 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01663 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01663 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01663 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01663 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01663 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01663 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01663 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01663 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01663 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01663 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01663 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01663 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01663 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01663 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01663 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01663 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01663 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01663 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01663 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01663 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01663 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01663 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01663 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01663 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01663 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01663 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01663 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01663 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01663 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01663 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01663 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01663 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01663 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01663 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01663 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01663 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01663 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01663 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01663 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01663 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01663 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01663 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01663 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01663 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01663 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01663 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01663 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01663 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01663 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01663 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01663 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01663 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01663 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01663 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01663 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01663 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01663 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01663 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01663 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01663 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01663 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01663 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01663 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01663 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01663 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01663 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01663 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01663 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01663 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01663 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01663 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01663 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01663 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01663 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01663 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01663 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01663 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01663 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01663 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01663 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01663 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01663 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01663 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01663 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01663 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01663 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01663 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01663 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01663 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01663 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01663 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms