Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms