Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Robo1O89026 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Robo1O89026 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Robo1O89026 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Robo1O89026 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Robo1O89026 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Robo1O89026 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Robo1O89026 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Robo1O89026 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Robo1O89026 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Robo1O89026 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Robo1O89026 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Robo1O89026 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Robo1O89026 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Robo1O89026 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Robo1O89026 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Robo1O89026 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Robo1O89026 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Robo1O89026 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Robo1O89026 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Robo1O89026 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Robo1O89026 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Robo1O89026 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Robo1O89026 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Robo1O89026 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Robo1O89026 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Robo1O89026 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Robo1O89026 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Robo1O89026 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Robo1O89026 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Robo1O89026 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Robo1O89026 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Robo1O89026 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Robo1O89026 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Robo1O89026 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Robo1O89026 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Robo1O89026 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Robo1O89026 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Robo1O89026 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Robo1O89026 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Robo1O89026 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Robo1O89026 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Robo1O89026 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms