Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Setdb1O88974 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Setdb1O88974 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Setdb1O88974 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Setdb1O88974 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Setdb1O88974 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Setdb1O88974 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Setdb1O88974 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Setdb1O88974 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Setdb1O88974 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Setdb1O88974 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Setdb1O88974 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Setdb1O88974 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Setdb1O88974 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Setdb1O88974 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Setdb1O88974 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Setdb1O88974 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Setdb1O88974 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Setdb1O88974 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Setdb1O88974 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Setdb1O88974 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Setdb1O88974 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Setdb1O88974 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Setdb1O88974 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms