Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcn2O88968 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcn2O88968 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcn2O88968 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcn2O88968 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcn2O88968 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcn2O88968 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcn2O88968 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcn2O88968 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcn2O88968 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcn2O88968 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcn2O88968 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcn2O88968 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcn2O88968 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcn2O88968 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcn2O88968 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcn2O88968 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcn2O88968 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcn2O88968 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcn2O88968 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcn2O88968 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcn2O88968 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcn2O88968 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcn2O88968 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcn2O88968 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcn2O88968 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcn2O88968 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcn2O88968 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcn2O88968 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tcn2O88968 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tcn2O88968 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tcn2O88968 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms