Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apaf1O88879 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms