Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
BlmO88700 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BlmO88700 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BlmO88700 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BlmO88700 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BlmO88700 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BlmO88700 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BlmO88700 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BlmO88700 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BlmO88700 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BlmO88700 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BlmO88700 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BlmO88700 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BlmO88700 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BlmO88700 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BlmO88700 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BlmO88700 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BlmO88700 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
BlmO88700 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BlmO88700 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BlmO88700 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BlmO88700 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BlmO88700 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BlmO88700 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BlmO88700 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BlmO88700 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BlmO88700 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BlmO88700 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BlmO88700 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BlmO88700 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BlmO88700 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BlmO88700 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BlmO88700 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BlmO88700 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BlmO88700 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
BlmO88700 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
BlmO88700 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BlmO88700 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BlmO88700 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BlmO88700 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BlmO88700 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BlmO88700 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BlmO88700 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
BlmO88700 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
BlmO88700 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
BlmO88700 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BlmO88700 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BlmO88700 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
BlmO88700 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BlmO88700 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BlmO88700 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BlmO88700 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BlmO88700 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BlmO88700 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BlmO88700 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
BlmO88700 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BlmO88700 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BlmO88700 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BlmO88700 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BlmO88700 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BlmO88700 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BlmO88700 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BlmO88700 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BlmO88700 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BlmO88700 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BlmO88700 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BlmO88700 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BlmO88700 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BlmO88700 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BlmO88700 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BlmO88700 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BlmO88700 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BlmO88700 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BlmO88700 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BlmO88700 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BlmO88700 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
BlmO88700 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BlmO88700 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BlmO88700 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BlmO88700 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BlmO88700 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BlmO88700 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BlmO88700 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
BlmO88700 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
BlmO88700 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BlmO88700 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
BlmO88700 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BlmO88700 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BlmO88700 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
BlmO88700 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BlmO88700 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BlmO88700 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BlmO88700 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BlmO88700 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BlmO88700 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BlmO88700 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BlmO88700 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BlmO88700 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BlmO88700 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BlmO88700 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms