Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dll3O88516 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dll3O88516 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dll3O88516 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dll3O88516 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Dll3O88516 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dll3O88516 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dll3O88516 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms