Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cfdp1O88271 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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