Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col5a1O88207 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Col5a1O88207 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col5a1O88207 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms