Protein–RNA interactions for Protein: O70546

Kdm6a, Lysine-specific demethylase 6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6aO70546 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kdm6aO70546 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm6aO70546 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms