Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Vamp4O70480 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms