Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lnx1O70263 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lnx1O70263 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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