Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms