Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap2O55126 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms