Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngr1O55100 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Syngr1O55100 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngr1O55100 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngr1O55100 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngr1O55100 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngr1O55100 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngr1O55100 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngr1O55100 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngr1O55100 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngr1O55100 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngr1O55100 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngr1O55100 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngr1O55100 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngr1O55100 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngr1O55100 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngr1O55100 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngr1O55100 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngr1O55100 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngr1O55100 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngr1O55100 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngr1O55100 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngr1O55100 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngr1O55100 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngr1O55100 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngr1O55100 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngr1O55100 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngr1O55100 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms