Protein–RNA interactions for Protein: O55033

Nck2, Cytoplasmic protein NCK2, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nck2O55033 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nck2O55033 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nck2O55033 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nck2O55033 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nck2O55033 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nck2O55033 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nck2O55033 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nck2O55033 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nck2O55033 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nck2O55033 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nck2O55033 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nck2O55033 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nck2O55033 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nck2O55033 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nck2O55033 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nck2O55033 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nck2O55033 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms