Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc3O55013 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms