Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp10aO54827 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp10aO54827 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms