Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gp1baO35930 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gp1baO35930 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gp1baO35930 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gp1baO35930 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gp1baO35930 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gp1baO35930 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gp1baO35930 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gp1baO35930 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gp1baO35930 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gp1baO35930 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gp1baO35930 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gp1baO35930 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gp1baO35930 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gp1baO35930 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gp1baO35930 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gp1baO35930 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gp1baO35930 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gp1baO35930 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gp1baO35930 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gp1baO35930 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gp1baO35930 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gp1baO35930 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gp1baO35930 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gp1baO35930 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gp1baO35930 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gp1baO35930 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gp1baO35930 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gp1baO35930 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gp1baO35930 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gp1baO35930 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gp1baO35930 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gp1baO35930 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gp1baO35930 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gp1baO35930 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gp1baO35930 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gp1baO35930 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gp1baO35930 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gp1baO35930 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms