Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cdk5r2O35926 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 300.8 ms