Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edil3O35474 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edil3O35474 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edil3O35474 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Edil3O35474 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Edil3O35474 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Edil3O35474 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Edil3O35474 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Edil3O35474 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Edil3O35474 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Edil3O35474 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms