Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd2O35392 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms