Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KeraO35367 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KeraO35367 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KeraO35367 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KeraO35367 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KeraO35367 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KeraO35367 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KeraO35367 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KeraO35367 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KeraO35367 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KeraO35367 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KeraO35367 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KeraO35367 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KeraO35367 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KeraO35367 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KeraO35367 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KeraO35367 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KeraO35367 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KeraO35367 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KeraO35367 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KeraO35367 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KeraO35367 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KeraO35367 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KeraO35367 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KeraO35367 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KeraO35367 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KeraO35367 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KeraO35367 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KeraO35367 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KeraO35367 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KeraO35367 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KeraO35367 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KeraO35367 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KeraO35367 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KeraO35367 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KeraO35367 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KeraO35367 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KeraO35367 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KeraO35367 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KeraO35367 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KeraO35367 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KeraO35367 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KeraO35367 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KeraO35367 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KeraO35367 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KeraO35367 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KeraO35367 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KeraO35367 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KeraO35367 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KeraO35367 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KeraO35367 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KeraO35367 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KeraO35367 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KeraO35367 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KeraO35367 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KeraO35367 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KeraO35367 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KeraO35367 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KeraO35367 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KeraO35367 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KeraO35367 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KeraO35367 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KeraO35367 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KeraO35367 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KeraO35367 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KeraO35367 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KeraO35367 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KeraO35367 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KeraO35367 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KeraO35367 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KeraO35367 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KeraO35367 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KeraO35367 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KeraO35367 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KeraO35367 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KeraO35367 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KeraO35367 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KeraO35367 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KeraO35367 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KeraO35367 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KeraO35367 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KeraO35367 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KeraO35367 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KeraO35367 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KeraO35367 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KeraO35367 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KeraO35367 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KeraO35367 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KeraO35367 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KeraO35367 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KeraO35367 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KeraO35367 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KeraO35367 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KeraO35367 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KeraO35367 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KeraO35367 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KeraO35367 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KeraO35367 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KeraO35367 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KeraO35367 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms