Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sh2d1bO35324 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh2d1bO35324 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh2d1bO35324 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh2d1bO35324 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh2d1bO35324 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh2d1bO35324 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh2d1bO35324 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh2d1bO35324 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh2d1bO35324 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh2d1bO35324 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms