Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pkd2O35245 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pkd2O35245 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pkd2O35245 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms