Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Ptpn9O35239 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn9O35239 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn9O35239 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn9O35239 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn9O35239 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn9O35239 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn9O35239 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn9O35239 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn9O35239 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Ptpn9O35239 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn9O35239 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn9O35239 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn9O35239 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Ptpn9O35239 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn9O35239 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
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Ptpn9O35239 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Ptpn9O35239 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn9O35239 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Ptpn9O35239 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn9O35239 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Ptpn9O35239 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn9O35239 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Ptpn9O35239 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Ptpn9O35239 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Ptpn9O35239 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Ptpn9O35239 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Ptpn9O35239 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn9O35239 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Ptpn9O35239 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn9O35239 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Ptpn9O35239 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn9O35239 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn9O35239 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn9O35239 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn9O35239 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn9O35239 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Ptpn9O35239 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn9O35239 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn9O35239 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn9O35239 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn9O35239 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn9O35239 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn9O35239 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn9O35239 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn9O35239 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn9O35239 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Ptpn9O35239 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms