Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ebi3O35228 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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