Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Kcns1O35173 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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