Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Polr1aO35134 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms