Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Casq1O09165 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Casq1O09165 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Casq1O09165 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Casq1O09165 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Casq1O09165 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Casq1O09165 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Casq1O09165 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Casq1O09165 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms