Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gfra2O08842 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms