Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CltaO08585 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CltaO08585 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CltaO08585 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CltaO08585 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CltaO08585 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CltaO08585 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CltaO08585 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CltaO08585 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CltaO08585 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CltaO08585 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CltaO08585 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CltaO08585 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CltaO08585 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CltaO08585 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CltaO08585 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CltaO08585 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CltaO08585 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CltaO08585 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CltaO08585 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CltaO08585 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CltaO08585 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CltaO08585 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CltaO08585 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CltaO08585 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CltaO08585 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CltaO08585 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CltaO08585 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CltaO08585 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CltaO08585 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CltaO08585 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CltaO08585 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CltaO08585 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CltaO08585 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CltaO08585 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CltaO08585 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CltaO08585 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CltaO08585 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CltaO08585 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CltaO08585 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CltaO08585 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CltaO08585 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CltaO08585 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CltaO08585 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CltaO08585 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CltaO08585 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CltaO08585 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CltaO08585 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CltaO08585 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CltaO08585 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CltaO08585 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CltaO08585 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CltaO08585 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CltaO08585 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CltaO08585 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CltaO08585 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CltaO08585 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CltaO08585 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CltaO08585 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CltaO08585 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CltaO08585 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CltaO08585 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CltaO08585 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CltaO08585 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CltaO08585 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CltaO08585 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CltaO08585 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CltaO08585 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CltaO08585 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CltaO08585 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CltaO08585 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CltaO08585 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CltaO08585 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CltaO08585 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CltaO08585 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CltaO08585 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CltaO08585 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CltaO08585 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CltaO08585 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CltaO08585 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CltaO08585 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CltaO08585 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CltaO08585 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CltaO08585 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CltaO08585 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CltaO08585 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CltaO08585 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CltaO08585 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CltaO08585 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CltaO08585 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CltaO08585 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CltaO08585 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CltaO08585 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CltaO08585 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CltaO08585 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CltaO08585 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CltaO08585 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CltaO08585 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CltaO08585 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CltaO08585 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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