Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccer2J3QPU5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccer2J3QPU5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.1 ms