Protein–RNA interactions for Protein: J3QPA5

Gm3099, Predicted gene 3099, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3099J3QPA5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3099J3QPA5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3099J3QPA5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3099J3QPA5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3099J3QPA5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3099J3QPA5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3099J3QPA5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3099J3QPA5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3099J3QPA5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3099J3QPA5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms