Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5294J3QP53 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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