Protein–RNA interactions for Protein: J3QNV7

Gm10428, Predicted gene 10428, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10428J3QNV7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm10428J3QNV7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm10428J3QNV7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm10428J3QNV7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms