Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms