Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm21411J3KMS0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21411J3KMS0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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