Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Taf4bG5E8Z2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf4bG5E8Z2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms