Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arfip1G5E8V9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms