Protein–RNA interactions for Protein: G3UW60

Susd5, MCG14773, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd5G3UW60 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd5G3UW60 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Susd5G3UW60 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms