Protein–RNA interactions for Protein: G3UW31

Vmn1r176, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r176G3UW31 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r176G3UW31 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r176G3UW31 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms