Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms