Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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