Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Farp1F8VPU2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms