Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M1F7CXU4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M1F7CXU4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms