Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms