Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm10378F6XQQ1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm10378F6XQQ1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm10378F6XQQ1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm10378F6XQQ1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm10378F6XQQ1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm10378F6XQQ1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm10378F6XQQ1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm10378F6XQQ1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm10378F6XQQ1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm10378F6XQQ1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm10378F6XQQ1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm10378F6XQQ1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm10378F6XQQ1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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Gm10378F6XQQ1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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Gm10378F6XQQ1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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Gm10378F6XQQ1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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Gm10378F6XQQ1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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Gm10378F6XQQ1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm10378F6XQQ1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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